Marmara Üniversitesinde Yerel Yönetimler Bölümü açma girişimi, uzun soluklu bir mücadele sürecinin sonucudur. Bu yöndeki ilk girişim, 1995 yılına kadar geri gider. Yerel yönetimlerin öneminin Türkiye’de henüz tam kavranamadığı bir dönemde Marmara Üniversitesi öğretim üyelerinden Prof. Dr. Ömer Dinçer’in inisiyatifi ile bu bölümlerin önemli bir gereklilik olduğu teziyle çeşitli girişimler başlatılmıştır. Bu girişimlerin sonucunda önce 1995 yılında Marmara Üniversitesi bünyesinde Yerel Yönetimler ön lisans programı kurulmuş, ardından yine aynı yılda, Sosyal Bilimler Enstitüsüne bağlı olarak yüksek lisans ve doktora programları kuruldu. 2012 yılında ise Yerel Yönetimler Lisans programı kurulmasına karar verildi. 

Yerel Yönetimler ve Kent Politikaları Yüksek Lisans ve Doktora programları, alanında Türkiye’de ilk kurulan programlardır. Mahalli İdareler ve Yerinden Yönetim adıyla 1995 yılında açılan bu programlar günümüze kadar aralıksız biçimde eğitime devam etmektedir.

2008 yılında ise İstanbul Araştırmaları Yüksek Lisans Programı açılmış olup, bu program hali hazırda Küresel Şehirler ve İstanbul Araştırmaları adı ile hem tezli hem tezsiz programda eğitim faaliyetlerine devam etmektedir.

Lisansüstü Programlar M.Ü. Sosyal Bilimler Enstitüsü bağlı olarak yürütülmektedir.